染色體自動分析報告.doc
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染色體自動分析報告,本文共計37頁,17761字; 摘要染色體結(jié)構(gòu)復(fù)雜,是dna和蛋白質(zhì)的合成物.人類的基因組有46條染色體 。其中里面有22對常染色體和一對性染色體。染色體分析的目的就是要確定細胞或個體的染色體組成,尤其是要將其與正常結(jié)構(gòu)間的偏差和生理的或臨床疾病關(guān)聯(lián)起來。模式識別技術(shù)的發(fā)展,以及圖像處理技術(shù)在醫(yī)學(xué)中的...
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染色體自動分析報告
本文共計37頁,17761字;
摘 要
染色體結(jié)構(gòu)復(fù)雜,是DNA和蛋白質(zhì)的合成物.人類的基因組有46條染色體 。其中里面有22對常染色體和一對性染色體。染色體分析的目的就是要確定細胞或個體的染色體組成,尤其是要將其與正常結(jié)構(gòu)間的偏差和生理的或臨床疾病關(guān)聯(lián)起來。模式識別技術(shù)的發(fā)展,以及圖像處理技術(shù)在醫(yī)學(xué)中的廣泛應(yīng)用,使得自動化染色體分析成為可能。利用計算機進行染色體自動分析會大大提高工作效率,也減輕了醫(yī)護人員的負擔(dān),并且它不依賴于工作人員的狀況。本文對染色體圖像進行了預(yù)處理,特征提取與選擇和初步分類分析,通過大量的實驗證明我們所采用的算法是有效的。
在染色體圖像的預(yù)處理過程中,首先進行閾值的計算,來尋找閾值,用該閾值處理后的圖像,有較好的分離特征。對染色體圖像進行處理以后,利用標號法實現(xiàn)了染色體圖像的自動分割,得到單條染色體圖像。在染色體的自動分割提取的過程中,可以對雜質(zhì)實行去除,而保留我們需要用來進行識別的染色體。面積,周長,著絲粒指數(shù)是識別染色體的重要特征。我們提取并選擇染色體的面積,周長,著絲粒指數(shù)作為以后分類的依據(jù)。
關(guān)鍵詞:自動染色體分析,閾值,自動分割,特征提取,細化,著絲粒指數(shù)
ABSTRACT
Chromosomes are highly structured,complexes of DNA and protein. The human genome consists of 46 chromsomes(22 paired autosomes and 2 sex chromosomes). The goal of chromosome analysis is to relate deviations from norma1s structure to biological or clinical effects .With the deve1opment of pattern recognition,and image processing methods begin widely used in medicine,automatic chromosome analysis becomes possible .The automatic karyotipintg wi11 increase then efficiency of availability,and relax then medical persons。At the same time then remote chromosome analysis becomes possible。In this paper,preprocessing,feature extraction and selection,and rough classification are performed on the chromosome images.Some experiments are made to verify the effectiveness of the methods presented.
目錄:
第一章 緒論
1.1染色體分析的意義
1.2 染色體自動分析系統(tǒng)
1.3染色體的發(fā)展歷史
1.4論文的主要工作
第二章 數(shù)字圖像處理以及模式識別的相關(guān)知識
2.1數(shù)字圖像處理的基礎(chǔ)知識
2.2二值圖像數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)的相關(guān)知識
2.3模式識別的相關(guān)知識及其應(yīng)用
2.4本章小結(jié)
第三章 染色體的處理
3.1圖像的預(yù)處理
3.2腐蝕與膨脹
3.3空穴填充
3.4骨架提取
3.5細化
3.6對染色體圖像的處理
3.7本章小結(jié)
第四章 特征提取
4.1特征的重要性
4.2圖像特征提取的一般方法
4.3對染色體圖像進行特征提取
4.3.1染色體面積的計算
4.3.2染色體周長的計算
4.3.3染色體長度的計算
4.4本章小結(jié)
第五章 總結(jié)
5.1實驗總結(jié)
5.2展望
部分參考文獻
[11彭天強.彭波.智能圖象處理技術(shù)[M].北京.電子工業(yè)出版社.2004.7
[2] 王曉丹.吳崇明.基于MATLAB的系統(tǒng)分析與設(shè)計——圖象處理[M].西安.西安電子科技大學(xué)出版社.2001.10
[3]Joseph C. Dagher Feature Selection For Pattern Recognition A Study for Human Bandend Chromosome Karyotyping Karyotype Image Analysis:counting overlapping chromosomes .2003.vol.26.11.p24-36
[4] 張凱麗,劉輝.一種確定染色體著絲粒位置的方法[J].昆明理工大學(xué)學(xué)報.2001.3.p110-113
[RM=450,350][/RM]取
本文共計37頁,17761字;
摘 要
染色體結(jié)構(gòu)復(fù)雜,是DNA和蛋白質(zhì)的合成物.人類的基因組有46條染色體 。其中里面有22對常染色體和一對性染色體。染色體分析的目的就是要確定細胞或個體的染色體組成,尤其是要將其與正常結(jié)構(gòu)間的偏差和生理的或臨床疾病關(guān)聯(lián)起來。模式識別技術(shù)的發(fā)展,以及圖像處理技術(shù)在醫(yī)學(xué)中的廣泛應(yīng)用,使得自動化染色體分析成為可能。利用計算機進行染色體自動分析會大大提高工作效率,也減輕了醫(yī)護人員的負擔(dān),并且它不依賴于工作人員的狀況。本文對染色體圖像進行了預(yù)處理,特征提取與選擇和初步分類分析,通過大量的實驗證明我們所采用的算法是有效的。
在染色體圖像的預(yù)處理過程中,首先進行閾值的計算,來尋找閾值,用該閾值處理后的圖像,有較好的分離特征。對染色體圖像進行處理以后,利用標號法實現(xiàn)了染色體圖像的自動分割,得到單條染色體圖像。在染色體的自動分割提取的過程中,可以對雜質(zhì)實行去除,而保留我們需要用來進行識別的染色體。面積,周長,著絲粒指數(shù)是識別染色體的重要特征。我們提取并選擇染色體的面積,周長,著絲粒指數(shù)作為以后分類的依據(jù)。
關(guān)鍵詞:自動染色體分析,閾值,自動分割,特征提取,細化,著絲粒指數(shù)
ABSTRACT
Chromosomes are highly structured,complexes of DNA and protein. The human genome consists of 46 chromsomes(22 paired autosomes and 2 sex chromosomes). The goal of chromosome analysis is to relate deviations from norma1s structure to biological or clinical effects .With the deve1opment of pattern recognition,and image processing methods begin widely used in medicine,automatic chromosome analysis becomes possible .The automatic karyotipintg wi11 increase then efficiency of availability,and relax then medical persons。At the same time then remote chromosome analysis becomes possible。In this paper,preprocessing,feature extraction and selection,and rough classification are performed on the chromosome images.Some experiments are made to verify the effectiveness of the methods presented.
目錄:
第一章 緒論
1.1染色體分析的意義
1.2 染色體自動分析系統(tǒng)
1.3染色體的發(fā)展歷史
1.4論文的主要工作
第二章 數(shù)字圖像處理以及模式識別的相關(guān)知識
2.1數(shù)字圖像處理的基礎(chǔ)知識
2.2二值圖像數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)的相關(guān)知識
2.3模式識別的相關(guān)知識及其應(yīng)用
2.4本章小結(jié)
第三章 染色體的處理
3.1圖像的預(yù)處理
3.2腐蝕與膨脹
3.3空穴填充
3.4骨架提取
3.5細化
3.6對染色體圖像的處理
3.7本章小結(jié)
第四章 特征提取
4.1特征的重要性
4.2圖像特征提取的一般方法
4.3對染色體圖像進行特征提取
4.3.1染色體面積的計算
4.3.2染色體周長的計算
4.3.3染色體長度的計算
4.4本章小結(jié)
第五章 總結(jié)
5.1實驗總結(jié)
5.2展望
部分參考文獻
[11彭天強.彭波.智能圖象處理技術(shù)[M].北京.電子工業(yè)出版社.2004.7
[2] 王曉丹.吳崇明.基于MATLAB的系統(tǒng)分析與設(shè)計——圖象處理[M].西安.西安電子科技大學(xué)出版社.2001.10
[3]Joseph C. Dagher Feature Selection For Pattern Recognition A Study for Human Bandend Chromosome Karyotyping Karyotype Image Analysis:counting overlapping chromosomes .2003.vol.26.11.p24-36
[4] 張凱麗,劉輝.一種確定染色體著絲粒位置的方法[J].昆明理工大學(xué)學(xué)報.2001.3.p110-113
[RM=450,350][/RM]取